рецепт лікування знайшовся на форумах videolan: потрібно налаштувати масштабування інтерфейсу qt перед стартом vlc:
QT_SCREEN_SCALE_FACTORS=0.5 vlc
зрозуміло, що не обов'язково щоразу друкувати так багато, можн експортувати змінну у файлі конфігурації ~/.bashrc, створити аліас для vlc з в тому ж таки ~/.bashrc тощо. головне, що після цього відео відтворюється нормально.